El Sector de Manufacturas de AGEXPORT está conformado por empresas fabricantes y exportadores de productos manufactureros. 

Apoya a los empresarios a consolidar la cadena de valor para que puedan acceder a nuevos mercados. Para ello se generan alianzas públicas y académicas, atendiendo temas como innovación, productividad, cumplimiento de normativa, actividades de networking, así como la participación en ferias tanto en el ámbito nacional como internacional. 

Los principales destinos de exportación de los productos manufacturados son Centroamérica, Estados Unidos, México y el Caribe.